Az Euro NCAP szervezet az Audi A3 passzív törésbiztonságát a legjobb eredménnyel, azaz öt csillaggal minősítette. A frontális, oldalsó, illetve ráfutásos ütközések során tanúsított felnőttutas-védelem, a gyermekbiztonság és a gyalogosvédelem terén egyaránt kategóriája egyik legbiztonságosabb autója az új Audi A3.

A tesztet végző szakemberek a legjobb minősítést adták az A3-nak a frontális, illetve oldalütközések során a vezető és a mellette ülő utas számára nyújtott védelméért. A gyermekek szintén nagyon nagy védelmet élvezhetnek az új Audi A3-ban. Az Euro NCAP az első és különösen a hátsó ülőhelyek esetében a biztonsági öv becsatolására figyelmeztető jelzést is értékelte. Mindkét rendszer szériafelszerelés az Audi A3 fedélzetén.

A gyalogosvédelem fontos szempont az Audinál, és ezt az A3 kimagaslóan teljesíti. A jármű orrának különleges kialakítása és az ütközéskor pirotechnikai úton kiemelkedő aktív motor-térfedél segítenek enyhíteni a balesetek kimenetelének súlyosságát. Ennek köszönhetően az Audi A3 e téren is nagyon jó pontszámot kapott.

Az Euro NCAP-tól kapott pontszámok mellett az Audi az aktív biztonságra is nagy hangsúlyt fektet. A szériafelszerelésnek számító nappali menetvilágítás révén a gyalogosok is jobban láthatják az autót. Továbbá az olyan vezetéstámogató rendszerek, mint a ráfutás veszélyére figyelmeztető és a fék-, valamint az utasvédelmi rendszereket felkészítő (Audi pre sense front) funkcióval kiegészített adaptív sebességtartó automatika (Audi cruise control), a sávelhagyásra figyelmeztető rendszer (Audi active lane assist), a sávváltást segítő holttérfigyelő rendszer (Audi side assist), a sebességkorlátozás kijelzése és a pihenésre figyelmeztető éberségfigyelő rendszer opcióként immár a kompakt kategóriában is elérhetőek. Ugyanez igaz a világításra is, ugyanis a folyamatos fénycsóvahossz-szabályozás és az opcionális, teljesen LED-es fényszóró eddig csak a felső kategóriában volt elérhető.

Ezenkívül az A3 egy ADAC által díjazott funkciót is szériában tartalmaz a biztonsági felszereltségei sorában, a tömegbaleset-megelőzést. Ez a funkció baleset esetén nyújthat segítséget a vezetőnek azáltal, hogy ütközéskor a jármű automatikus befékezésével csökkenti a kipördülés, illetve a további sorozatütközések veszélyét.